高純化單元內裝陰陽離子交換樹脂，在離子交換反應中，水中的陽離子（如Na+）被轉移到樹脂上去了，而離子交換樹脂上的一個可交換的H+轉入水中。Na+從水中轉移到樹脂上的過程是離子的置換過程。而樹脂上的H+交換到水中的過程稱游離過程。因此，由于置換和游離過程的結果，使得Na+與H+互換位置，這一變化，就稱為離子交換。同理，陰樹脂置換出OH-，從而生產H2O。樹脂交換具有交換容量高、水流阻力小、機械強度高、化學穩定性好，同時又具有可逆性的交換反應，便于再生，對各種不同離子吸附的選擇來達到除鹽、提純的目的。經過高純化柱的純水電阻率可達10 MΩ?cm@25℃以上。